Dalam bidang keilmuan , biru metilen dikenal sebagai metilthionin klorida, yaitu zat warna yang digunakan sebagai pewarna untuk pigmen beberapa bagian tubuh seseorang, sebelum atau selama operasi. Dokter pada dasarnya menggunakannya sebagai antiseptik dan kauterisasi internal.
Ini juga digunakan sebagai cat pada noda untuk pengamatan yang dilakukan melalui mikroskop, dan untuk mengecat hasilnya di laboratorium, karena memiliki kemampuan untuk mewarnai urin dan feses. Akhirnya itu juga digunakan dalam pengobatan untuk menurunkan methemoglobin. Di antara karakteristiknya adalah bahwa ia merupakan unsur yang tersusun dari kristal, berwarna hijau tua terang, tidak berbau dan tidak berubah oleh udara.
Ini dapat dengan mudah dilarutkan dalam air dan dengan hati-hati dalam alkohol dan ketika bersentuhan dengan mereka, warnanya berubah menjadi biru tua, juga digunakan untuk memerangi jamur kuku, juga dapat digunakan untuk mengecat pakaian putih, bila mulai menjadi kekuningan.
Dalam budidaya ikan banyak digunakan untuk mengobati infeksi pada ikan tropis, sangat efektif dalam memerangi parasit protozoa yang merupakan penyebab infeksi pada ikan. Pada dasarnya digunakan untuk merawat telur yang baru saja diletakkan oleh ikan, agar tidak terinfeksi oleh bakteri atau jamur apapun, sangat berguna jika ingin menetaskan telur secara artifisial. Orang dapat membeli biru metilen tanpa resep, umumnya digunakan sebagai antiseptik topikal.
