Mereka mewakili penyatuan dua atau lebih asam amino melalui hubungan antara yang asli dan peptida. Dalam produk dan protein, ikatan ini terkait dengan ikatan peptida dan hasil reaksi gugus karboksil, dengan gugus amino lain, dengan eliminasi molekul air.
The peptida obligasi (-CO-NH-) biasanya direpresentasikan sebagai ikatan tunggal. Namun, tanpa, memiliki sejumlah karakteristik yang mendekati ikatan rangkap. Karena nitrogen kurang elektronegatif daripada oksigen, ikatan CO memiliki karakter ikatan rangkap 60% sedangkan ikatan CN 40%. Oleh karena itu, ikatan CO dan NC dari ikatan peptida memiliki karakteristik antara ikatan tunggal dan ikatan rangkap. Faktanya, jarak antar atom yang diukur dalam ikatan CO dan CN merupakan perantara antara hubungan tunggal dan ikatan rangkap. Susunan atom ini distabilkan oleh resonansi, sehingga enam atom yang terlibat dalam pembentukan ikatan peptida berada pada bidang yang sama.
Konsekuensi penting lainnya dari resonansi adalah meningkatkan polaritas ikatan peptida dan membentuk momen dipol (gambar kanan pada tabel di atas). Untuk alasan ini, setiap ikatan peptida dapat berpartisipasi dalam dua ikatan hidrogen. Di salah satunya, gugus -NH- bertindak sebagai donor hidrogen dan yang lain, gugus -CO- bertindak sebagai reseptor hidrogen. Sifat ini berkontribusi secara signifikan pada pelipatan tiga dimensi protein, seperti yang akan kita lihat nanti.
The parsial Sifat dari ikatan ganda mencegah rotasi bebas dari ikatan yang bergabung dengan C dan N atom dalam ikatan peptida. Kekakuan ikatan rangkap ini membatasi kemungkinan konformasi peptida. Ada dua kemungkinan konfigurasi:
- Konfigurasi Cis: kedua Ca berada pada sisi ikatan rangkap yang sama.
- Konfigurasi trans: kedua Ca berada pada sisi ikatan rangkap yang berbeda.
Perlu dicatat bahwa secara umum ikatan peptida direpresentasikan sebagai ikatan tunggal. Bagaimanapun, ia memiliki beberapa karakteristik yang membuatnya mendekati ikatan rangkap. Itulah sebabnya para ahli umumnya menyebutkan bahwa ikatan peptida memiliki sifat yang menempatkannya di tengah-tengah antara ikatan tunggal dan ikatan rangkap.
